Skyrim in finestra

Ma dubito seriamente che centri il sistema operativo, non esiste proprio.
Hai controllato le opzioni nel launcher? C'è da mettere/togliere la spunta su Modalità finestra e puoi controllare anche Aspect Ratio e Risoluzione, non la puoi cambiare dall'interno del gioco ma solo da lì. Sicuramente il problema è vicino, in game non ci sono quelle opzioni grafiche.